Die Museumsinsel Lüttenheid besteht aus insgesamt sieben Häusern: dem Stadehaus, der ehemaligen Schmiede, dem alten Pferdestall, dem Klaus Groth Literaturhaus und einem Museumsshop sowie Magazingebäuden.
Wie sich Heide von der Gründung an bis in die 1950er Jahre entwickelt hat, erfahren Besucher:innen im Stade-Haus und in der Alten Schmiede. Zu sehen sind unter anderem eine Rekonstruktion des ältesten Kachelofens des Nordens, ein Trinkpokal der seit 1621 nachgewiesenen und noch bestehenden Heider Papagoyengilde sowie die Werke des Heider Comicpioniers Rudolph Dirks. Mit „The Katzenjammer Kids“ erfand Dirks einen der ersten und ältesten noch publizierten Comic Strips der Welt. Erzählt wird darin die Geschichte der Brüder Rudolph und Gus Dirks aus Heide, die am Ende des 19. Jahrhunderts einen kometenhaften Aufstieg im Verlag des Zeitungszaren William Randolph Hearst erlebten.
Im Alten Pferdestall dreht sich alles um das Heider Handwerk. Besucher:innen erwarten verschiedene nachgebaute Werkstätten, darunter eine Stellmacherei, Tischlerei und Schuhmacherwerkstatt sowie eine Goldschmiede und Schneiderei samt alten Geräten und Werkzeugen, wie zum Beispiel eine alte Nähmaschine oder zahlreiche Hobel und Sägen.
Ein weiteres Museum ist dem berühmten Sohn der Stadt Klaus Groth gewidmet. Der niederdeutsche Dichter lebte von 1819 bis 1899. Im Geburtshaus des Autors, dem heutigen Klaus Groth Literaturhaus, bekommen Interessierte anhand von Hörproben und Originaldokumenten Einblicke in das Leben und Schaffen des plattdeutschen Poeten.